چیزی که شهرت لیندبرگ را بیش از پیش افزایش داد، اتفاقی تراژیک و سهمناک بود که طومار خوشبختی او را برای همیشه درهمپیچید. پنجسال بعد از عبور لیندبرگ از عرض اقیانوس اطلس، پسر کوچک او چارلز جونیور ربوده شده و به قتل رسید. این جنایت به دلیل شهرت لیندبرگ انعکاس عجیبی در رسانهها پیدا کرد و در دهه ٣٠ میلادی به جنایت قرن شهرت یافت.