زلزله خاموش اصفهان، چند سالی است که این شهر تاریخی را تهدید میکند. فرونشست زمین در بخشهای قابل توجهی از این شهر باعث شده تا بناهای تاریخی هم این تهدید را بهطور کامل حس کنند. « مسجد سید » اصفهان هم یکی از شاخصترین بناهای باشکوه دوران قاجار در اصفهان است که تاثیرات فرونشست در نقاط مختلف آن بسیار مشهود است، همانطور که کارشناسان هم هشدار دادهاند امروز ترک خوردن طاق، گنبد، ایوانها، سقف در این بنای تاریخی، این بنای تاریخی را در وضعیت هشدار جدی قرار داده است.
مسجد سید یکی از بناهای تاریخی متعلق به دوره قاجاریه است که دارای صحن، ایوان، گنبد خانه، شبستان ستوندار، رواق و غرفههای دو طبقه است. این بنا که از بزرگترین مساجد تاریخی شهر اصفهان است؛ به دلیل مدیریت چندگانه میراث فرهنگی، اوقاف و هیات امنا با خطر نابودی مواجه شده است. بنایی که علاوه بر فرونشست، بی توجهی در حفظ ونگهداری خطر نابودی آن رابیشتر کرده است.